環(huán)境與生態(tài)學(xué)院成立于2011年3月，是在原海洋與環(huán)境學(xué)院的環(huán)境學(xué)科和生命科學(xué)學(xué)院的生態(tài)學(xué)科基礎(chǔ)上整合組建起來的學(xué)院。“學(xué)院雖新，但學(xué)科歷史悠久”，我院的生態(tài)學(xué)科可追溯至1922年，環(huán)境學(xué)科可追溯至1982年。

經(jīng)過多年建設(shè)，環(huán)境科學(xué)為國家重點學(xué)科，生態(tài)學(xué)和環(huán)境工程為福建省重點學(xué)科。2017年9月，我院的生態(tài)學(xué)入選國家“雙一流”建設(shè)學(xué)科。根據(jù)ESI統(tǒng)計，我校環(huán)境與生態(tài)學(xué)科從2012年起進入全球排名前1%，2019年最新位次率已提升至前0.431%。

學(xué)院平臺及支撐體系建設(shè)成效頗豐，擁有近海海洋環(huán)境科學(xué)國家重點實驗室（和海洋與地球?qū)W院共建）、濱海濕地生態(tài)系統(tǒng)教育部重點實驗室和4個省級科研平臺（福建省海陸界面生態(tài)環(huán)境重點實驗室、福建省濱海濕地保護與生態(tài)恢復(fù)工程技術(shù)研究中心、福建省水環(huán)境健康與安全協(xié)同創(chuàng)新中心、福建省海岸帶污染防控重點實驗室）。2019年8月，獲批建設(shè)臺灣海峽海洋生態(tài)系統(tǒng)教育部野外科學(xué)觀測研究站，目前已被推薦申報國家野外科學(xué)觀測研究站。

學(xué)院以培養(yǎng)開拓、創(chuàng)新、國際型本碩博、博后人才為中心，為環(huán)境美好、生態(tài)文明提供廣泛社會服務(wù)；以濱海濕地、海岸帶、流域的環(huán)境、生態(tài)及科學(xué)管理研究為重點，為保護與修復(fù)、合理利用、防災(zāi)減災(zāi)服務(wù)。特別是在研究方面，瞄準(zhǔn)全球變化和人類活動等多重壓力下近海－流域與濕地生態(tài)系統(tǒng)演變機制的重大科學(xué)前沿，同時針對國家與地方對近海－流域－濕地生態(tài)安全和防災(zāi)減災(zāi)的重大需求。本學(xué)科群（環(huán)境與生態(tài)學(xué)科）以亞熱帶水域生態(tài)系統(tǒng)(流域－河口－近海)和濱海濕地生態(tài)系統(tǒng)為主要研究對象，主攻水域和濕地生態(tài)系統(tǒng)與環(huán)境演變過程與機理及其生態(tài)環(huán)境效應(yīng)，建立生態(tài)系統(tǒng)水平的海陸統(tǒng)籌管理的理論體系，同時大力發(fā)展環(huán)境工程、生態(tài)工程和環(huán)境評價等相關(guān)應(yīng)用類學(xué)科的發(fā)展。

學(xué)院擁有建筑面積為2萬平方米的大樓，為學(xué)院的科學(xué)發(fā)展和人才培養(yǎng)提供了良好的教學(xué)科研條件和發(fā)展空間。