作為海口市水環(huán)境綜合整治重點項目之一，備受爭議、長時間進行方案論證的金牛湖水環(huán)境綜合治理工程，主要建設內(nèi)容包括南入口污水處理站、內(nèi)源污染的治理、湖體生態(tài)系統(tǒng)的治理、湖體水質日常處理保持等四大部分組成。

首先，將金牛湖南入口主要污染源截流及預處理后，流至速分池進行生化處理。其次，對南、北湖中間左岸糧庫宿舍區(qū)排出的生活污水進行截流，通過化糞池進行預處理，然后將收集的生活污水排至南入口處理站進行處理。第三，在南湖和北湖流動性較差的位置建10座無動力復氧床，促進水體流動，增加水體溶解氧。最后，在金牛湖湖內(nèi)建設植物浮島、生物柵，種植挺水、沉水植物，并投放水生動物，從而形成相對完整的微生物、植物、動物的水生生態(tài)系統(tǒng)，提高金牛湖的自凈能力，使金牛湖內(nèi)的生態(tài)系統(tǒng)恢復正常，水質得以長期保持。